Alternatiivsed protseduurid on need täiendavad audititestid, mida kasutatakse juhul, kui kavandatud auditiprotseduuride algset komplekti ei saa teha või kui see osutub ebaefektiivseks. Näiteks saadab audiitor kliendi klientidele saadaolevaid kinnitusi, kuid vastuseid on nii vähe, et audiitor peab kasutama alternatiivseid protseduure, näiteks hilisemate kassatulu võrdlemist aasta lõpu nõuete jääkidega. Samamoodi ei saa audiitor osaleda kliendi aasta lõpu tegeliku varude loendamises ja otsustab seetõttu kasutada alternatiivset protseduuri, mis on valmistoodangu hilisema müügi jälgimine aasta lõpu varude kirjeteni.
Pärast alternatiivsete protseduuride läbiviimist peab audiitor kindlaks tegema, kas on kogutud piisavalt täiendavaid auditi tõendeid. Kui ei, tuleb läbi viia täiendavad alternatiivsed protseduurid. Kui kõik audititestid on lõpule viidud, peaks audiitor need dokumenteerima auditi töödokumentides.