Kontrollisüsteem ei anna absoluutset kindlust organisatsiooni kontrollieesmärkide täitmise eest. Selle asemel on igas süsteemis mitu olemuslikku piirangut, mis vähendavad kindluse taset. Need olemuslikud piirangud on järgmised:
Kokkumäng. Kaks või enam inimest, kelle jaoks kontrollisüsteem on ette nähtud üksteise valvamiseks, võivad selle asemel süsteemist kõrvale hiilida.
Inimlik viga. Juhtimissüsteemis osalev inimene võib lihtsalt vea teha, unustades võib-olla juhtimissüsteemi kasutamise. Või ei saa inimene aru, kuidas juhtimissüsteemi kasutada, või ei mõista süsteemiga seotud juhiseid. Selle põhjuseks võib olla vale inimese määramine ülesandele.
Juhtimine alistab. Keegi juhtimismeeskonnast, kellel on selleks volitused, võiks oma isiklikuks eeliseks alistada kontrollisüsteemi mis tahes aspekti.
Puudub kohustuste eraldamine. Juhtimissüsteem võis olla kavandatud ülesannete ebapiisava eraldamisega, nii et üks inimene saaks selle nõuetekohast toimimist segada.
Järelikult tuleb nõustuda, et ükski sisekontrollisüsteem pole täiuslik. Alati on viis, kuidas see võib ebaõnnestuda või sellest mööda hiilida.